Edunvalvonta sektoreittain
Apteekkisektori
Suomen Farmasialiitto neuvottelee ja sopii Apteekkien Työnantajaliitto ry:n kanssa apteekkien farmaseuttista henkilöstöä koskevan työehtosopimuksen. Myös sopimuksen tulkinnasta johtuvat erimielisyydet ja tulkinnat ratkaistaan näiden sopimusosapuolten kesken. Farmasialiiton jäsenistä ne opiskelijat, jotka eivät ole pakollisessa harjoittelussa, mutta kuitenkin työskentelevät apteekeissa, ovat toisen sopimuksen, Apteekkien työntekijöitä koskevan työehtosopimuksen piirissä.
Kunta- ja valtiosektori
Julkisen sektorin työehdoista sopii Julkisalan koulutettujen neuvottelujärjestö JUKO ry. Akavalainen luottamusmies edustaa jokaisessa kunnassa tai valtion laitoksessa myös Farmasialiittoon kuuluvia. Paikalliset erimielisyydet ratkaistaan akavalaisen luottamusmiesten toimesta ja tarvittaessa asia saatetaan JUKOn edelleen neuvoteltavaksi.
Ylemmät toimihenkilöt
Ylemmille toimihenkilöille sopii palkankorotukset Ylemmät Toimihenkilöt YTN ry. Farmasialiiton jäsenet ovat YTN:n yritysyhdistysten mukana toiminnassa ja YTN:n yhdyshenkilöt hoitavat myös Farmasialiiton jäsenten asiat paikallisesti.
Muu yksityinen sektori
Ne Farmasialiiton jäsenet, jotka eivät ole työssä apteekeissa tai julkisella sektorilla eivätkä myöskään työskentele ylempinä toimihenkilöinä, ovat useimmiten teollisuustoimihenkilöitä. Heidän osaltaan on sovittu Ammattiliitto Pron kanssa edunvalvonnan jakamisesta siten, että Pro hoitaa heidän palkkauksellisen edunvalvontansa ja Farmasialiitto puolestaan ammatillisen edunvalvonnan. Teollisuustoimihenkilöinä työskenteleviä kehotetaan liittymään suoraan Pron jäseniksi, ja ilmoittamaan tämän jälkeen rinnakkaisjäsenyydestään Farmasialiitossa Farmasialiiton jäsenpalveluun.
Farmaseutteja ja proviisoreja toimii muissakin kuin edellä mainituissa tehtävissä jonkin verran. Tällöin liitto ei suoranaisesti sovi tai vaikuta heidän työehtoihinsa, mutta kaikki muut jäsenedut, kuten työttömyyskassa, oikeusturva ja ammatillinen edunvalvonta ovat näidenkin jäsenten palveluina.
Työsuhdeneuvonta